Пишутся возражения, как я понимаю есть акт налоговой проверки, вот и обосновывайте свою точку зрения. Если это Вам для учебы, то рекомендую подумать самостоятельно. Если у Вас реальные проблемы с налоговой, тогда лучше обратитесь к специалисту. Какие бы акты разногласий, или возражения Вы в налоговую не представили. решение 99,9% будет под копирку с акта налоговой проверки, если налоговая не права, тогда в суд.
в свободной форме самое главное обосновать разногласия разделите страничку пополам. в одной стороне будет что написано в акте позиция налогового органа. в другой как считаете вы позиция предприятия. наверху рекивизиты юридического лица и налогового органа и обязательно их представителей. внизу подписи сторон и печати. главное ваши возражения должны быть основаны на законе.